
为了研究Indel的产生机制,在部分排除了复制滑动和转座等因素之后,发现在非洲猪瘟病毒基因组中大量发生的重组事件与基因组Indel的发生存在明显的关联,因此基因组重组很可能导致了基因组片段Indel(特别是大的Indel)的发生。
大部分重组事件都是基因型特异的,而且发生在基因组的两端。最后,研究团队发现非洲猪瘟病毒基因组中存在大量33~49 bp的重复序列,它们以成簇的形式出现,而且在重组区域的重复元件明显大于非重组区域,表明重复元件有利于基因组重组的发生。
综上,非洲猪瘟病毒基因组中存在的大量重复元件有利于基因组重组的发生,重组进一步导致了病毒基因组的多样性以及病毒表型(如抗原/致病性等)的多样性,极大增加了防控该病毒的难度。
本工作的完成不仅有利于增强对于非洲猪瘟病毒进化机制的理解,而且也为该病毒的防控提供了一定的科学依据。相关结果于2019年8月10日在线发表于国际兽医学权威期刊《Veterinary Microbiology》,论文原文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0378113519304183?via%3Dihub。